Praktiline töö - SDS-PAGE PROTEOOMIKA
laetud elektrood).
Polüakrüülamiid geel piirab molekulide migreerumiskiirust, kusjuures väiksemad molekulid
liiguvad kiiremini, kui suuremad molekulid. Kuna massi ja laengu suhe on erinevatel SDS-
denatureeritud polüpeptiididel peaaegu sama, toimub erinevate valkude eraldamine
polüpeptiidide molekulmasside alusel.
SDS-PAGE abil valkude eraldamist saab kasutada: valkude suhteliste molekulmasside
hindamiseks, valkude sisalduse määramiseks proovis, valguproovide puhtuse hindamiseks,
valkude puhastamise ja fraktsioneerimise jälgimiseks.
Denaturatsiooniks kasutatav detergent SDS lagundab natiivseid valke, lõhkudes valkudel nii
sekundaar- ja tertsiaarstruktuuri kui ka kvarternaarstruktuuri.
Polüpeptiidide omavaheline kovalentne seondumine vähendab valguproovi analüüsi täpsust,
kuna sama molekulmassiga bändid võivad sisaldada ühte polüpeptiidi või dimeeri/terrameeri.