Mikroobifusioloogia
lahtisulamist, mis päädib RNAP dissotseerumisega DNA-lt. Ühe hüpoteesi kohaselt
ppGpp seondub diskriminaatorjärjestuses olevate C-nukleotiididega ning takistab
sedasi promootori vabastamist.
Promootorid, mida ppGpp pärsib, on diskriminaatorjärjestusega
promootorid, mis on aktiveeritavad negatiivse superspiralisatsiooniga. Tavaliselt
on selliste promootorite vaheala lühem N=16. Seevastu promootorid, millel on
diskriminaatorpiirkonnas AT-rikas järjestus või on pikema vahealaga N=18 pole
ppGpp-ga represseeritavad. Pikema vahealaga promootorid on negatiivse
superspiralisatsiooni vähenemisel pigem aktiveeritud, tänu -10 ja -35 elementide
nihkumisele õigesse positsiooni statsionaarses kasvufaasis.
Teise hüpoteesi kohaselt RNAP on statsionaarses kasvufaasis ebastabiilsem
tänu sellele, et RNAP-ga on seondunud transkriptsiooni regulaatorvalk DksA, mis
seondub polümeraasiga ning takistab avatud kompleksi moodustumist. Alarmoon
annaabi.ee 
