Vajad kellegagi rääkida?
Küsi julgelt abi LasteAbi
Logi sisse
Sulge

"ultrameetriline" - 1 õppematerjal

ultrameetriline ehk juurest kõigi tippudeni peab harudepikkuste summa olema sama.
Molekulaarne evolutsioon
58
docx

Molekulaarne evolutsioon

puu sobivust andmetele. Võimaldavad võrrelda konkureerivaid hüpoteese/puid. Kuid on arvutuslikult väga kallid ning optimaalse puu leidmiseks pole teada tõhusaid algoritme. Suurema arvu järjestuste korral pole parima puu leidmine garanteeritud. 30. Iseloomustage kaalumata paaride meetodit aritmeetilise keskmisega (UPGMA). UPGMA meetod on distantsmeetod, mis kasutab klasterdamisalgoritmi. UPGMA eelduseks on, et puu on ultrameetriline ehk juurest kõigi tippudeni peab harudepikkuste summa olema sama. Eeldab, et evolutsiooni kiirus on konstantne üle kogu puu. 31. Võrrelge minimaalse evolutsiooni (minimum evolution) ja naabrite ühendamise (neighbour joining) meetodit. Minimaalse evolutsiooni meetod on distantsmeetod aditiivsete puude konstrueerimiseks. Optimummeetod, mis valib kõige lühema puu. Naabrite ühendamise meetod on klastermeetod, mis naabrite tuvastamisega minimeerib puu pikkust

Bioloogia → Geneetika
27 allalaadimist


Sellel veebilehel kasutatakse küpsiseid. Kasutamist jätkates nõustute küpsiste ja veebilehe üldtingimustega Nõustun