"ttgat" - 1 õppematerjal

Bakterirakkude kasv ja seda mõjutavad tegurid

Fnr on transkriptsiooniregulaator, mis kontrollib nii fermenteerimise kui ka anaeroobse hingamise radade ekspressiooni. Vastavad geenid ja operonid kuuluvad fnr moduloni ning on aktiveeritavad anaeroobsetes ja represseeritavad aeroobsetes tingimustes. Fnr on aminohappeliselt järjestuselt väga sarnane CRP valgule (v.a. tsüsteiini-rikas järjestus valgu N-terminuses). Samuti on sarnased mõlema valgu seondumisjärjestused. Fnr boksi moodustavad 5-bp pikkused pöördkordusjärjestused TTGAT----ATCAA, CRP boksi aga järjestused TGTGA----TCACA. Arvatakse, et Fnr on evolutsioneerunud CRP-st crp geeni duplitseerumise järel. Fnr tunnetab väliskeskkonna redoks-staatust. [4Fe-4S] 2+ klaster võimaldab siduda kaks Fnr subühikut ja selline kompleks seondub DNA-ga. Hapniku toimel moodustuv [2Fe-2S] 2+ klaster muudab Fnr-i konformatsiooni nii et see ei ole enam võimeline dimeriseeruma. Fnr-i monomeerid DNA-ga ei seondu.