Ensümoloogia
Metalliioonid
suurendavad veemolekuli nn happelisust (ionisatsiooni). Vee molekuli pK on kõrge H 2O pKa=15,6 ehk
-log(10-1455). 55 on molaarmass ja 10-14 on vee ioonkorrutis. Vesi on nõrk hape, ei taha prootonit loovutada, aga
kui vee molekul on assotsieerunud pos laenguga molekuliga (ntx koobalt Co), siis
Co3+ H2OCo3+HO- + H+ ja pKa=6,5 (pKa väheneb, muutub tugevaks happeks, OH- neg laeng on stabiliseeritud
pos laenguga).
Karboksüpeptidaasi reaktsioonis täidab tsingiaatom kahte
funktsiooni:
58
Stabiliseerib negatiivset laengut. C= on pos osaleng, =O on neg osaleng. Tsink assisteerib OH -
moodustumist, mis on hea hape ja siis nn ründab pos osalaengut.
Kovalentne katalüüs
Oluline nukleofiil on seriini hüdroksüülrühm.
Ser-OH, mingi alus assisteerib seriini hüdroksüüli deprotoneerimist, et oleks efektiivsema nukleofiiliga tegemist.
Nukleofiilsus on tuuma armastus