“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
Aktseptoorse õla 3’ otsas paikneb üheahelaline
CCA76 järjestus, millele liidetakse aminohape. CCA järjestuse olemasolu on tRNA’de
universaalne omadus, sest kõikide tRNA’de 3’ ots peab sobituma ribosoomi dekodeerivasse
tsentrisse. Nukleotiidi positsioonis 73 nimetatakse diskriminaatoriks, kuna see on oluline
tRNA äratundmisel aa-tRNA süntetaasi (aaRS) poolt. tRNA 5’ terminaalne nukleotiid omab
5’-fosfaatgruppi. Aktseptorõla pikkus on 7 bp (erandiks on tRNAHis). Aktseptorõla ja D-õla
vahel on alati 2 nukleotiidi.
D-õla nimetus tuleneb sellest, et pea-aegu alati esineb selles tRNA osas üks või mitu
dihüdrouridiini (uridiini pürimidiinring on küllastunud). Tegemist on post-transkriptsioonilise
modifikatsiooniga. D-õla pikkus on enamasti 4 bp ning D-lingu suurus varieerub 8-11 aluseni.
D-õla ja antikoodon-õla vahele jääb alati üks nukleotiid.
Antikoodon-õlg on alati 5 aluspaari pikk ja sisaldab antikoodonit. Antikoodon lingus on alati