“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
vabanemisfaktor ribosoomilt klass I faktori ja lahkub seejärel ise ribosoomilt.
Klass I polüpeptiidi vabanemisfaktorid prokarüootides
Prokarüootides: RF1 : tunneb ära UAG ja UAA koodoni. RF2 : tunneb ära UGA ja UAA
koodoni. Ribosoomiga seondumisel konf. muutus RF1/2-s. Domeen III liigub eemale dom. II-
st. Domeen III GGQ motiiv satub peptidüültransferaassesse tsentrisse. GGQ-motiiv : sama
nii RF1-s kui RF2-s, domeenis III, vajalik pept-tRNA hüdrolüüsiks. “Tripeptiidne
antikoodon” - : domeenis II, P(A/V)T – RF1, SPF – RF2, vajalik STOP-koodoni
äratundmiseks. “antikoodoni” vahetus RF1 ja RF2 vahel paneb RF1 ära tundma RF2 koodonit
(UGA) ja vice versa (Ito et al. 2000). RF1/RF2. Pos 1. Ainult pürimidiin (C,U) mahub
19
“seondumise taskusse” Aga C ei annaks vajalikke H-sidemeid RF1 jääkidega T186 ja G116↓
Seega sobib ainult U. RF1. Pos2