"trifosfataaset" - 1 õppematerjal

Grupp III dsRNA viirused

Struktuursete valkude (tähistatakse VP1 ­ 6, virion protein) funktsioonidest on teada et: - VP1 on rotaviiruse RdRp; seondab järjestus-spetsiifiliselt viiruse RNAd; - VP2 (core struktuuri peamine valk) on järjestus-mittespetsiifiliselt RNA-d siduv valk, mis on vajalik replikatsiooniks ja võib olla ka segmentide sorteerimiseks; - VP3 on GT/MT (cap-sünteesi ensüüm). Vähemalt üks rotaviiruse "core" struktuuri valk (siiani ei ole teada, milline nendest) omab arvatavasti ka RNA-trifosfataaset, NTP-aaset ja RNA helikaaset aktiivsust. - VP4 on partikli väliskihi valk, üks rotaviiruse peamisi antigeene. Funktsionaalselt on VP4 hemoglutiniin ja rotaviiruse antiretseptor. Virioni valgud VP5* ja VP8* on VP4 lõikamisproduktid (lõikamist teostavad raku trüpsiin-tüüpi proteaasid). Nagu ka reoviirustel, on ka rotaviirustel kapsiidi valgu proteolüüs oluline virionide rakkudesse sisenemiseks (kuid mitte rakkudele seondumiseks);