Mikroobifusioloogia
Kuigi
taimedes on väga kirju seltskond baktereid, moodustavad valdava osa
endofüütidest ainult 4 hõimkonna liigid: Proteobacteria (54%), Actinobacteria
140
(20%), Firmicutes (16%) ja Bacteroidetes (6%). Samad hõimkonnad on valdavalt
ka taimede risosfääris. Arhesid on kirjeldatud ainult üksikutel juhtudel, neid on
leitud maisist, kohvipuu marjadest ning arktilises tundras kasvavates lugades
(Juncus trifidus). Kuigi taimedest on leitud valdavalt neljast hõimkonnast
baktereid, kuuluvad bakterid väga paljudesse perekondadesse ning taim-bakter
suhe, kas tegu on mutualismi või patogeensusega, sõltub rohkem taime ja
bakteri genotüübist, kui sellest, millise bakterina on ta varem kirjeldatud.
Proteobacteria hõimkonnast on enim leitud taimedest -proteobaktereid
(26%), millest omakorda on enim kirjeldatud liike perekondadest Pseudomonas,
annaabi.ee 
