Evolutsioon
suhted - dN/dS= a)0.2; b) 1; c) 10. Mida võib sellest nende geenide evolutsiooni kohta järeldada?
a. Puhastav valik (ilmselt suurema funktsionaalse piiranguga geen). b. Kas negatiivse
(puhastava) valiku lõdvenemine või positiivne valik. c. Positiivne valik.
11. Kas sünonüümsed asendused on päris neutraalsed? Kirjelda koodonikasutuse kallutatuse
valiku-mutatsioon-triivi (Selection-mutation-drift) hüpoteesi.
tRNAde kättesaadavus on olulisem intensiivselt transleeritavate valkude jaoks. Nende geenides
on koodonikasutuse kallutatus (codon bias) suurem ja sünonüümseid asendusi vähem.
Selection-mutation-drift hüpotees: erinevused kõrgelt (valik) ja madalalt (mut./triiv)
ekspresseeritud geenides. Kõrgelt ekspresseeritud geenides toimib puhastav valik vastavalt
tRNA-de hulgale rakus. Sellega pidurdub sünonüümsete evolutsiooni kiirus - vastavalt Kimura'le
funktsionaalsed piirangud tingivad evolutsiooniliste kiiruste aeglustumise. Seega sünonüümsed