Viirused
splaissingut, põhjustavad transpordi tsütoplasmasse. Infektsiooni hilistes faasides võimendab rex selektiivselt teatud
struktuurgeenide ekspressiooni, mida rohkem vajatakse. Tax on transkriptsioooni aktivaator, võimendab viiruse genoomi
transkriptsiooni. Tax aktiveerib ka teisi geene: IL2, IL3, GMCSF, IL2 retseptor, mis kõik põhjustavad T kasvu stimulatsiooni.
HIV replikatsiooni reguleerivad 6 geeni „lisa”produkti. Tat on viiruse ja raku geenide transaktivaator. Rev toimib nagu rex. Nef
vähendab CD4 ja MHCI ekspressiooni rakupinnal, muudab rakusiseseid signalisatsiooniradu, reguleerib viiruse tsütotoksilisust, on
vajalik, et toota suuri viirushulki (oluline AIDSiks muutumisel). Vif promob montaaži ja seostub raku viirusvastase valguga, et ta
ei saaks cDNAd hüpermuteerida. Vpu vähendab CD4 ekspressiooni ja võimendab virioni vabastamist. Vpr on oluline cDNA
transpordiks tuuma, viiruse replikatsiooniks mittekasvavates rakkudes (nt. makrofaagid).