Bakterirakkude kasv ja seda mõjutavad tegurid
(näiteks statsionaarse faasi rakkudes suureneb negatiivne superspiralisatsioon) ja DNA kompaktsuse astmes
mõjutab transkriptsiooni regulaatorite seondumisefektiivsust DNA-le ka spetsiifiliste DNA regioonide
lokaalne konformatsiooni muutus.
Järgnevalt on toodud detailsem informatsioon nukleoidi valkude kohta.
CbpA (curved DNA-binding protein A) seondub DNA-ga mittespetsiifiliselt ja on detekteeritav alles
hilises statsionaarses faasis. 36 tunni vanuses rakukultuuris on seda valku 3% totaalvalgust, mis teeb
ligikaudu 15000 valgumolekuli raku kohta.
29
CbpB (Rob) (curved DNA-binding protein B, right origin binding protein) ekspresseerub maksimaalsel
tasemel eksponentsiaalselt kasvavates rakkudes, kus teda on üle 10000 molekuli raku kohta. Statsionaarse
faasi rakkudes väheneb CppB hulk 60%-le maksimaalsest tasemest. Selle valgu osalust on näidatud nii
transkriptsiooni kui ka replikatsiooni kontrollis.