"tobamoviirustel" - 1 õppematerjal

Viroloogia

Ω-liider ei oma sekundaarstruktuuri ja toimib translatsioonilise enhanserina (“cap”). Ω-liider osaleb ka TMV genoomi replikatsioonis.  Subgenoomsed promooterid asuvad sgRNA-de transpkriptsioonisaitidest ülapool. o MP sgRNa sünteesitakse infektsioonifaasis ja suhteliselt vähesel hulgal. o CP sgRNA sünteesitakse hiljem ja ta on väga mažoorne.  IRES- elemendid (võivad erinevatel tobamoviirustel asuda MP ja /või CP geeni ees) ning võimaldavad vastavate valkude transaltsiooni otse genoomselt RNA-lt.  Genoomi 3’ ots moodustab tRNA like struktuuri. Viiruse seisukohalt on tRNA-like struktuur negatiivse RNA ahela sünteesil promootoriks ja arvatavasti ka kaitseks raku ribonukleaaside vastu. TMV genoomi kodeerivad alad ORF1- 126 kDa valk, TMV replikaasi subühik, seondub infitseeritud rakkudes membraaniga