Biosüstemaatika teooria ja meetodid
ette antud piirangud - meie poolt õigeks peetavate muutuste mudeli, mida
programm on sunnitud järgima. (Vt. joon. 9.) Näiteks teame, et molekulaar-
süstemaatikas kasutatavate nukleotiidide sekventsi tunnuste puhul transver-
sioon toimub harvemini kui transitsioon. Võime analüüsi eel ette anda seda
arvestava tunnuse muudatuste puu (vt. joon. 10).
8.9. Puude ehitamisele asudes võime lähtuda meie poolt ette antud hüpo-
teetilisest eellasest, mille puhul kõigile tunnustele on meie poolt juba
antud nende seisund (näit. 0). Nii oli see kombeks veel kümme-neliteist
aastat tagasi, kui ei tuntud välisrühma-meetodit. Selline lähenemine sisal-
dab suurt subjektiivse vea ohtu ja seda välditakse. Mõeldav on küll anda
hüpoteetilise ühiseellase selline iseloomustus, milles osa tunnuste puhul
on antud põhjendatult eeldatavseisund, teiste puhul aga ainult küsimärk.