Genoomi struktuur ja funktsioon
Otsene eemaldamine on
nt aluspaari eemaldamine ja mittemetüleeritud aluse inserteerimine base excision
repair mehanismi kaudu (BER). Või eemaldatakse terve DNA lõik mis täidetakse
nukleotiididega nukleotide excision repair (NER) poolt. Edasi modifitseeritud
tsütosiini puhul tekib oksüdatsiooni käigus hüdroksümetüültsütosiin, mis
deaminaaside poolt deamineeritakse, nt AID/Apobec, TET. Deaminatsiooni ja
oksüdatsiooni produktid parandatakse TDG glükosülaasi poolt mis on seotud BER
mehanismiga.
•
• DNA hüdroksümetülatsioon: levik genoomides (mida tänaseks teada), roll(id)
genoomide) funktsioonis.
• TET – ten-eleven translocation ensüüm oksüdeerib 5-metüültsütosiini 5-
hüdroksümetüültsütosiiniks. Hüpoteesi järgi on 5hmC intermediaat 5mC
eemaldamisel. TET üleekspressioon vähendab 5hC taset ja TET kaotamine viib
5mC akumuleerumisele
annaabi.ee 
