Populatsioonigeneetika 2014
Näiteks, LD (D=0.4) kahe 0,03 cM kaugusel paikneva lookuse vahel.
Mis juhtub LD-ga peale viit põlvkonda? Mis põhjustab LD muutuse? DtAB=(1-θ)tD0AB
6) Kuidas rekombinatsiooni kiirus on kromosoomidel jaotunud (ühtalset/mitteühtlaselt)? Miks
täheldame haplotüübiblokke 1K alsupaari (1000 aluspaari) tasemel ? Üldiselt on mitmekesisus väiksem
seal, kus rekombinatsiooni on vähe- tsentromeerile lähemal ja väikestes kromosoomides. Põhjusteks ongi
ilmselt selective sweep-id ja taustavalik. Selective sweep korral toimub kasulik mutatsioon ühes liinis ning valik
hakkab soosima just seda haplotüüpi koos lähedal asuvate aheldunud lookustega, mistõttu see üsna kiiresti
fikseerub. Teiste haplotüüpidega seotud varieeruvus antud lookuses läheb seetõttu populatsioonist kaduma.
Aja möödudes lisandub juba fikseerunud haplotüüpidele uusi mutatsioone ja varieeruvus tõuseb.
Nädal 7