Molekulaarbioloogia
Seondumine muudab DNA kuju (160 kraadine pööre).
Sunnib DNA-d kokku keerama. On näide, kuidas transkriptsiooni initsiatsiooni puhul
konformatsioon muutub. ülimalt oluline. Eukarüootidel on DNA e kromatiini struktuuri
muutusel vältimatu eeltingimus. DNA peab muutuma. Üks neist, kes kuju muudavad
kindla koha peal on TBP. NB! DNA topoloogia muutub ka peale initsiatsiooni ka
elongatsiooni puhul. Tekib keerde sisse (supervindid + ja – pidi) – topoisomeraasid.
TATA box - TATAXAX ( X = A/T) äratundmispiirkond – kui sellest mööda saab, siis
transkriptsioon võib pihta hakata.
TFIID – koosneb paljudest valkudest. Võib ära tunda erinevaid piirkondi promootoril,
sest on palju subühikuid.
Oluline on eukarüootsete promootorite puhul start sadi ümbruses. Kui 1. nukleotiid
lülitatakse 5’ otsa mRNA-l. Oma konsensusjärjestus, mis bakteriaalsetel promootoritel
pole. Need esinevad ka kodeeriva järjestuse sees.