"taaskonstrueeritud" - 1 õppematerjal

Koostu tegemine algusest peale: mida iga bioloog peaks teadma

Samuti peab silmas pidama, et programm tuleb valida vastavalt andmete spetsiifikale: see, mis sobib hästi prokarüootsete genoomide puhul, ei pruugi sarnaseid tulemusi eukarüoodsete organismide korral saavutada. Selleks, et paraneks koostute kvaliteet, tuleb tõsta sekveneerimisprotsessi kvaliteeti. Samuti annab paremaid tulemusi, kui kasutada lisainformatsiooni näiteks transkribeeritud RNA-d koostute tegemisel. Kui tundub, et mingi piirkond genoomis on kehvasti taaskonstrueeritud, võib seda parandada kasutades suunatud sekveneerimist. Igatahes on vajalik edasine meetrikute analüüs, töötada uusi välja ja leida spetsiaalseid meetrikuid ka raskemate genoomsete piirkondade jaoks. Kasutatud kirjandus Fleischmann, R.D., Adams,M.D., White, O., Clayton, R.A., Kirkness, E.F., Kerlavage, A.R., Bult, C.J., Tomb, J.F., Dougherty, B.A., Merrick, J.M., et al. (1995). Whole-genome random sequencing and assembly of Haemophilus influenzae Rd. Science 269 (5223): 496-512.