Peipsi järve ökosüsteem
väike konnarohi, väike penikeel,
vesinaaskelleht, mõru vesipipar,
punakas penikeel.
Vetikaid üle 900 liigi.
Zooplanktoneid on vähemalt 160 liiki.
Rohke planktoni ja põhjaloomastiku tõttu on järv kalarohke Järves elab 37 liiki
kalu. Nendest iseloomulikumad on rääbis, ahven, peipsi tint ja haug.
9 liiki kahepaikseid (nt. veekonn ja järvekonn)
Peipsit kasutab igal aastal peatuspaigana üle miljoni rändlinnu
(nt. laululuiged, rabahaned, suurlaukhaned)
Soo ja veelinde üle 100 liigi (sealhulgas pesitsejaid ligi 40). Pesitsejatest
näiteks,naerukajakad, sinikaelpardid, tuttpütid, kõrkjaroolinnud.
Suuremad probleemid on põlevkivi kaevandamine,
põllumajanduses kasutatavad väetised ning sellest
kõigest tulenev liigtoitelisus ehk eutroofsus.
Probleemiks on ka kalade ülepüük. Aastas
püütakse Peipsist ligikaudu 10 000 tonni kala.
Probleemiks on järves tekkiv hapnikupuudus.
annaabi.ee 
