Viroloogia
Alfa-viiruse genoom
Alfa- viiruste genoomne RNA on ca 12 kb pikkune. Teda iseloomustaks:
Genoom 5’-otsas cap-struktuur;
Genoom 3’- otsas asub polyA järjestus, ca 70 jääki;
5’-terminaalne 2/3 genoomi kodeerib mittestruktuurseid valke (NSP,
ekspresseeruvad otse genoomilt).
3’- poolne 1/3 genoomi kodeerib struktuurseid valke (SP) ja
ekspresseerub sgRNA kaudu. sgRNA sünteesitakse infektsiooni käigus
(virionides seda ei ole) subgenoomselt promootorilt viiruse RdRp poolt.
sgRNA on capeeritud ja polüadenüleeritud.
Seondumine rakule ja sisenemine rakku
Rakkudesse sisenemiseks kasutatakse alternatiivseid retseptoreid. Alfa-viiruse
antiretseptoriks on E2 glükoproteiin. Retseptor-antiretseptor interaktsioon
indutseerib virionis konformatsioonilised muutused, mis on olulised partikli edasisel
lahtipakkimisel.
Rakku sisenemine toimub retseptor- vahendatud endotsütoosi teel, viiruse
annaabi.ee 
