"subgenoomsed" - 1 õppematerjal

Viroloogia

kuivainest) kuid ei tapa reegline nakatunud rakke. TMV genoomi mittekodeerivad alad TMV genoom on 6395 nukleotiidi pikk ja sisaldab:  5’- mittetransleeritav liider (Ω-liider): on 70 b mittetransleeritav ala, mida iseloomustab G- jääkide puudumine. Ω-liider ei oma sekundaarstruktuuri ja toimib translatsioonilise enhanserina (“cap”). Ω-liider osaleb ka TMV genoomi replikatsioonis.  Subgenoomsed promooterid asuvad sgRNA-de transpkriptsioonisaitidest ülapool. o MP sgRNa sünteesitakse infektsioonifaasis ja suhteliselt vähesel hulgal. o CP sgRNA sünteesitakse hiljem ja ta on väga mažoorne.  IRES- elemendid (võivad erinevatel tobamoviirustel asuda MP ja /või CP geeni ees) ning võimaldavad vastavate valkude transaltsiooni otse genoomselt RNA-lt.  Genoomi 3’ ots moodustab tRNA like struktuuri