Meditsiinilise mikrobioloogia praktikum
agaroosi tüübist ja kontsentratsioonist.
VOOLUPINGE. Madala voolupinge juures on lineaarse DNA fragmentide liikumise kiirus
proportsionaalne pingega. Kui elektrivälja tugevus tõuseb, hakkavad pikad fragmendid liikuma
erineva kiirusega. Seega pinge tõustes väheneb agaroosgeeli lahutusvõime. Et saavutada >2kb
DNA fragmentide maksimaalne lahutuvus, tuleks geeli jooksutada tingimuses, kus oleks 5-8V/cm
kohta.
AGAROOSI TÜÜP. Agaroosid jagatakse:
• standardagaroos
• madala sulamistemperatuuriga agaroos (low melting agarose)
• vahepealse sulamis-geelistumistemperatuuriga agaroosid
Igas grupis on erinevaid agaroositüüpe, mida kasutatakse vaid teatud juhtudel.
ELEKTROFOREESI PUHVER. DNA liikumist mõjutavad elektroforeesipuhvri koostis ja
ioontugevus. Ioonide puudumisel (kui foreesipuhvri asemel oleks vesi) on elektrijuhtivus
minimaalne ja DNA migreerub väga aeglaselt või üldse mitte. Väga kõrge ioonse jõuga puhvris
(nt
annaabi.ee 
