"splaisssaidiga" - 1 õppematerjal

Molekulaarbioloogia

RNA-d on vähe, aga olemasolu tähtis. Kõik väikesed snRNA-d komplekseeruvad valkudeta, moodustavad U- d. 5’ splaissimissaidi järjestus on kindel – koosneb ca 6-st nukleotiidist. Hargnemiskohas on oma konsensusjärjestus. Poly Py (polüpürimidiin-track)– U-C rikas järjestus, see on hargnemiskoha ja 3’ splaissimiskoha vahel. Koosneb paljudest pürimidiinidest. ehk järjestuselemendid, mis 65 tuleb ära tunda. U1 RNA (tunneb ära) paardub 5’ splaisssaidiga. Poly Py järjestusega seostub valk U2AF (U2 aktiveeriv valk). Hargnemiskoha järjestusega seostub valk BBP – branch binding protein. Valgu ja RNA äratundmine – valgud tunnevad ära kindlaid struktuurielemente. Varane kompleks ehk e-kompleks. U2 RNA paardub hargnemiskoha konsensusjärjestusega - üheselt määratud 6-nukleotiidiline + A, mid jääb üle ja ei paardu - kõikidel intronitel sama. Nii tekib A-kompleks– seal toimub ATP hüdrolüüs