"splaissimissaidi" - 1 õppematerjal

Molekulaarbioloogia

Kuigi on 3’ → 5’ fosfodiesterside, siis nüüd on 2’→5’ . Selleks, et reaktsioon saaks toimuda, peavad need kohad sattuma üksteisele lähedale. Hiljem peavad 5’ ja 3’ splaisserid kokku sattuma. Kui kuskil jääb nukleotiid lisaks, läheb lugemisraam paigast ära. Splaissosoom koosneb rohkem kui 150-st valgust ja RNA-st. RNA-d on vähe, aga olemasolu tähtis. Kõik väikesed snRNA-d komplekseeruvad valkudeta, moodustavad U- d. 5’ splaissimissaidi järjestus on kindel – koosneb ca 6-st nukleotiidist. Hargnemiskohas on oma konsensusjärjestus. Poly Py (polüpürimidiin-track)– U-C rikas järjestus, see on hargnemiskoha ja 3’ splaissimiskoha vahel. Koosneb paljudest pürimidiinidest. ehk järjestuselemendid, mis 65 tuleb ära tunda. U1 RNA (tunneb ära) paardub 5’ splaisssaidiga. Poly Py järjestusega seostub valk U2AF (U2 aktiveeriv valk). Hargnemiskoha järjestusega seostub valk