Molekulaarbioloogia
Erinevad RNA splaissimistüübid
- splaissosoomi (RNA + valk, katalüüsib intronite eemaldamist) suunatud
splaissimine
- esimene reaktsioon toimub splassingukompleksiga. 5’ splaissingu saiti tekib cycl.
Vaheühend, vabaneb 5’ eksoni 3’ ots, mis atakeerib 3’ splaissi, vabaneb intron, mis on
seotud splassingu kompleksiga ja ekson.
- isesplaissuvaid introneid (ei vaja lisakomponente, kui siis Mg ja ühevalentseid
katioone, ribosüümid) on 2 tüüpi:
1) Tüüp II – sarnane premRNA splaissimisele, kuid ei kasuta välispidiseid faktoreid
2) Tüüp I – erinevad teistest, kuna kasutavad G-nukleotiidi kofaktoreid. G-nukleotiidi
3’OH atakeerib 5’ splassingu saiti, G-nukleotiid seotud 5’ otsaga, tsüklilist vaheühendit
ei teki.
- seda viivad läbi valgud, RNA ise ei osale
- pärmide tRNA geenides esineb splaissimine, RNA on seal substraadiks
Tüüp I ja II isesplaissuvad intronid lõikavad ennast välja preRNA-st, erinevalt mRNA
intronitest ei pea nad olema tingimata mRNA-s