Praktiline töö - SDS-PAGE PROTEOOMIKA
kuna sama molekulmassiga bändid võivad sisaldada ühte polüpeptiidi või dimeeri/terrameeri.
Taolise probleemi ärahoidmiseks kasutatakse proovi ettevalmistamise käigus redutseerivat
agenti dithiothreitol (DTT või Clealand`i reagent) või 2-merkaptoetanooli (2-ME).
Redutseerivates tingimustes lagunevad disulfiidsidemed ning disulfiidseotud valkude
oligomeerid algunevad.
„Plaat” geeli vorm koosneb kahest paralleelsest klaasplaadist või plastiklehest, mille vahele
on asetatud tihendid (spacerid) vahemiku tekitamiseks ning geeli äravoolu takistamiseks
servadest.
SDS-PAGE elektroforeesi puhul kasutatakse kihilist kahe geeli kombinatsiooni. Esmalt
valatakse kahe plaadi vahele lahutav geel ning järgnevalt kontsentreeriv geel.
Kontsentreerivasse geeli asetatakse enne polümeriseerumist kammid, mille abil tehakse geeli
taskud proovide jaoks. Lahutav ja kontsentreeruv geel erinevad puhvri konsentratsiooni ja pH
poolest.
annaabi.ee 
