Geeniperekonnad
homoloogia kaudu, esineb ka arvuliselt pseudogeene. *Liitklastrites (compound clusters)
paiknevad geeniperekonnad on füüsiliselt vähem seotud ning seal esineb ka eelmistega
mitteseotud järjestusi (nt. HLA kompleksis 6p21.3 asuvad lisaks HLA ja komplemendi
geenidele ka näiteks steroid 21-hüdroksülaasi geeniperekond
2)Mitmete klastritena: *Harvadel juhtudel paiknevad klasterdatud geeniperekonnad
hiljutise duplikatsiooni tulemina ühes kromosoomis (SMN1ja SMN2). Reeglina on
homoloogia kõrgem klastrite sees kui klastrite vahel.
3)Hajutatud geeniperekonnad: *Eri asukohtades olevad geenid on tavaliselt
divergeerunud (lahknenud) järjestustega. *Nad võivad olla pärit, kas erinevatest
genoomidest (mitokondriaalses s.t. bakteriaalses genoomis esinevate geenide ülekanne
nukleaarsesse). *Vanadest geeni või genoomi duplitseerumistest (PAX geenid).
Homoloogia vaid teatud domäänide piires. *Retrotranspositsiooni tagajärjed (paljud