Mikroobifusioloogia
sarnased tüüp IV piilid. Tüüp III sekrestsioonisüsteem, mille abil süstitakse
efektoreid eukarüootidesse on sarnased nii inimpatogeenidel kui ka taime
koloniseerivatel mikroobidel. Lisaks veel antibiootikumiresistentsuseks
kasutatavad pumbad on olulised nii inimese kudede kui ka taimekudede
efektiivseks koloniseerimiseks. Näiteks Stenotrophomonas maltophila kliiniliselt
olulised tüved, mille kinoloonide resistsust tagav eflukspump SmeDEF on oluline
tomati juurte edukaks koloniseerimiseks.
Taimekudesid on võimelised edukalt koloniseerima inim-, loom- kui ka
taimpatogeenid. Inimese patogeenid perekondadest Enterobacter, Pseudomonas,
Staphylococcus, Mycobacterium, Escherichia jpt võivad olla taimes
mutualistlikeks endofüütideks ning soodustada taime kasvu, samas on nad
tuntud kui inimese ohtlikud patogeenid. Enterobacteriaceae on suur sugukond,
millest on paljud bakterid tuntud inimese patogeensete tüvedena