"sigman" - 1 õppematerjal

Mikroobifusioloogia

Suurem ja üldisem on sigmaD perekond, millest on evolutsiooni käigus tekkinud palju alternatiivseid sigma faktoreid, nagu S, H , F. Nendel sigma faktoritel on peale aminohappelise järjestuse suhteliselt sarnane ka DNA järjestus, mida nad ära tunnevad. Tavaliselt on bakterites 1 või 2 sigma faktorit, mis on sigma70 perekonnast erinevad. E. coli's on selleks N, mis on vajalik N-metabolismi geenide ekspressiooniks. Erinevalt sigmaD-tüüpi sigma faktoritest vajab sigmaN transkriptsiooni initsieerimiseks alati aktivaatoreid, mis võivad seonduda DNA-ga promootorist ebatüüpiliselt kaugel. Eraldi alternatiivsete sigma faktorite rühma moodustavad sigmaD superperekonda kuuluvad ekstratsütoplasmaatilise funktsiooniga sigma faktorite alamperekond ECF (inglise keeles extracytoplasmic function). Need alternatiivsed sigma faktorid reguleerivad raku ümbrisega seotud funktsioone, nagu