"sigmah" - 1 õppematerjal

Mikroobifusioloogia

-10 element on suhteliselt sarnane sigmaD -10 elemendiga. -10 elemendist ülesvoolu on konserveerunud lisanukleotiidid, mida sigmaD -10 elemendil pole. SigmaS-i promootorite vaheala pikkus varieerub rohkem kui sigmaD vaheala pikkus. SigmaN (-24 element, vaheala, -12 element) TGGCAC N6 TGC E. coli sigmaN-i konsensus DNA-l erineb sigmaD konsensusest tugevasti ning põhimõtteliselt seisneb -12 positsioonis konserveerunud GC-s ja -24 positsioonis konserveernud GG-st. SigmaH (-35 element, vaheala, -10 element) CCTTGAA N 14(1) CCCATTTA SigmaF (-35 element, vaheala, -10 element) TAAAGTTT N 11 GCCGATAA RNAP on väga suur valk, u 450 kDa raske, ning sellest johtuvalt katab RNAP DNA promootoralas kuni 110 nukleotiidi (-90 ... +20 nukleotiidi geeni esimesest nukleotiidist). Sellest johtuvalt muutused selles piirkonnas mõjutavad transkriptsiooni initsiatsiooni ja seega ka geenide avaldumist. Sellest johtuvalt jaotatakse DNA piirkonnad kolmeks: -90 ..