"sigmafaktorita" - 1 õppematerjal

Molekulaarbioloogia

5) promootori puhastamine täisensüüm – holoensüüm - α2 β β’ sigma põhiensüüm - α2 β β’ kui RNA polümeraas seondub sigmafaktoriga, siis hakatakse otsima promootorjärjestust. Kui leiti, siis polümeraas ei dissotseeru, aga sigmafaktor teeb seda. Erinevad sigmafaktorid tunnevad ära erinevaid DNA järjestusi (tagab promootori ja ahela spetsiifika, nõrgendab RNA polümeraasi seondumist). Kiire protsess. RNA polümeraasi põhiensüüm võib ka ilma sigmafaktorita kompleksi moodustada (aga väga väikeses osas). Põhiline on sigma 70. rpoD ⁞ 70 kD ⁞ üldine ⁞ TTGACA (-35) ⁞ 16-18 bp ⁞ TATAAT (-10) rpoH ⁞ 32 kDa ⁞ heat shock ⁞ COCTTGAA ⁞ 13 – 15 bp ⁞ COCGATNT rpoN ⁞ 54 kDa ⁞ lämmastik ⁞ CTGGNA ⁞ 6 bp ⁞ TTGCA Initsiatsioon RNA polümeraas + sigma subühik → kiire protsess DNA otste lahtisulamine → avatud kompleksi moodustamine, tunduvalt aeglasem, kui esimene protsess (miljard x)