sigma faktorite ekspressiooni rakus on võimalik reguleerida stimulone sigma faktoritega. 8.2. Sigma faktorid ja promootorite konsensused Tavaliselt on bakteritel üks peamine sigma faktor ning palju alternatiivseid sigma faktoreid, mille ekspressioon on aktiveeritud spetsiifilistes tingimustes. E. coli kõige olulisem -faktor on D ( 70), mis on vajalik elutähtsate geenide avaldumiseks ning see sigma faktor on bakteris alati olemas. Sigma70 abil ekspresseeritakse E. coli's enamikke geene. Teised, nn alternatiivsed sigma faktorid, on ekspresseeritud spetsiifilise stressi korral. Kõige üldisem alternatiivne 70 sigma faktor on S (38), mis vastutab üldise stressivastuse geenide transkriptsiooni aktivatsiooni eest. SigmaS ekspresseerub rakkudes kasvu aeglustumise faasis. Lämmastiku limitatsiooni vastuse geenide avaldumise eest
Kõigi nende nukleotiidide asukohti DNA-s, mis jäävad initsiatsioonisaidist ,,ülespoole", seega 5´ suunas, näidatakse ,,-" märgiga, mis aga jäävad ,,allapoole", näidatakse ,,+" märgiga. Järgnevalt leiab täpsemat käsitlust bakteris Escherichia coli toimuv transkriptsiooni initsiatsioon. Bakteris E. coli (nii nagu ka teistes graam-negatiivsetes bakterites) on mitu erinevat sigma faktorit, millest põhiline 68 on sigma70. See sigma faktor võimaldab ära tunda promootoreid, milles on konserveerunud kaks 6- nukleotiidset regiooni, mida nimetatakse 35 elemendiks ja 10 elemendiks (need järjestused paiknevad transkriptsiooni alguspunktist keskmiselt 35 ja 10 nukleotiidi kaugusel). 35 elemendis on konserveerunud (esinevad kõige sagedamini) nukleotiidid TTGACA, -10 elemendis aga TATAAT. DNA ahelate lahtisulamine transkriptsiooni initsiatsioonil hõlmab ka regiooni, kus paikneb A:T-rikas 10 element (DNA
nukleotiidi lülitamine RNA ahelasse) tähistatakse +1. Kõigi nende nukleotiidide asukohti DNA-s, mis jäävad initsiatsioonisaidist ,,ülespoole", seega 5´ suunas, näidatakse ,,-" märgiga, mis aga jäävad ,,allapoole", näidatakse ,,+" märgiga. Järgnevalt leiab täpsemat käsitlust bakteris Escherichia coli toimuv transkriptsiooni initsiatsioon. Bakteris E. coli (nii nagu ka teistes graam-negatiivsetes bakterites) on mitu erinevat sigma faktorit, millest põhiline on sigma70. See sigma faktor võimaldab ära tunda promootoreid, milles on konserveerunud kaks 6- nukleotiidset regiooni, mida nimetatakse 35 elemendiks ja 10 elemendiks (need järjestused paiknevad transkriptsiooni alguspunktist keskmiselt 35 ja 10 nukleotiidi kaugusel). 35 elemendis on konserveerunud (esinevad kõige sagedamini) nukleotiidid TTGACA, -10 elemendis aga TATAAT. DNA ahelate lahtisulamine transkriptsiooni initsiatsioonil hõlmab ka regiooni, kus paikneb A:T-rikas 10 element (DNA