"seondumispositsiooni" - 1 õppematerjal

“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid

Subühikute omavaheline ~ 10 kraadi nihkumine katkestab kontaktid RF1/2 ja ribosoomi vahel: ▫ RF1/2 – dekodeeriv tsenter ▫ RF1/2 – L11 stalk RF1/2 dissotsieeruvad ribosoomilt. RRF ehk ribosoomi retsükleerimisfaktor (ingl. ribosome recycling factor). 2 domeeni: domeen I (“saba”) ja domeen II (“pea”). Seondub 70S ribosoomiga : domeen I : 50S ja domeen II : 30S. Koos EF-G-ga põhjustab 70S lagunemise subühikuteks. RRF-i kaks seondumispositsiooni : Pos 1 – 70S ribosoomil ja Pos 2 – 50 subühikul. RRF seondub RS-ga enne EF-G-d. RRF ja EF-G seondumiskohad kattuvad kui RRF positsioonis 1. Järeldus : EF-  20 G seondumisel võtab RRF sisse positsiooni 2 ( GTP hüdrolüüsi järel liigud EF-G dom Iv dom III poole ja selle väänad välja RF pea). RRF minek positsiooni 2 lõhub subühikutevahelised sillad B2a ja B3