Populatsioonigeneetika 2014
See näitab sekventside hulka
populatsioonis, mis esindab igat vaadeldud sekventsi alleeli (eeldusel, et individuaalid on haploidsed või
homosügootsed). SFS, mida teatakse kui HFD aitab identifitseerida efektiivse populatsiooni suuruse kasvu või
kahanemist kui vaadeldavad järjestused on neutraalsed.
kui on teada, et sekventsid tulevad konstantse efektiivse suurusega populatsioonist, siis need tulemused
kirjeldavad neutraalse selektsooni tagajärgi.
Mitmed analüüsid kasutavad asenduste sagedusspektrit, et arvutada nullhüpotees konstantse efektiivse
populatsiooni suurusele läbi aja kasutades selleks DNA järjestusi.
Testil on mitmeid piiranguid:
1. Rekombinatsiooni esinemine. Rekombinatsioon valib uusi haplotüüpide järjestusi olemasolevatest ja nii
tehes katkestab arusaamad mutatsioonidest, mida seostati enne kas teatud rahvustega, haigustega
jne