Populatsioonigeneetika 2014
3. Mida saab välja lugeda populatsiooni sisese paariviisiliste erinevuste jaotusest JÜRI
4. Mis asi on asenduste sagedusspekter (Site Frecuency Spectrum) ja mida võiks järeldada kui näeme
populatsioonis palju rohkem haruldasi mutatsioone kui konstantset populatsioonisuurust eeldava koalesentsi
mudeli põhjal simuleeritud andmetes? Kristine
Asenduste sagedusspekter ehk haplotüüpide sageduste distributsioon. See näitab sekventside hulka
populatsioonis, mis esindab igat vaadeldud sekventsi alleeli (eeldusel, et individuaalid on haploidsed või
homosügootsed). SFS, mida teatakse kui HFD aitab identifitseerida efektiivse populatsiooni suuruse kasvu või
kahanemist kui vaadeldavad järjestused on neutraalsed.
kui on teada, et sekventsid tulevad konstantse efektiivse suurusega populatsioonist, siis need tulemused
kirjeldavad neutraalse selektsooni tagajärgi.