"sekveneerimiskeskus" - 1 õppematerjal

Koostu tegemine algusest peale: mida iga bioloog peaks teadma

tulemuste tõlgendamine. Joonis 1. Genoomi koostu paneb genoomi kokku lühikestest DNA sekventsijuppidest. Koostu kvaliteet Kuigi esineb teravaid probleeme koostute tegemisel, ei takista see asjaolu uute genoomiprojektide alustamist. Projekt i5k alustati aastal 2009 ja selle eesmärgiks on 5000 putukagenoomi sekveneerimine. Sellele järgneb Genome 10K projekt, mille eesmärk on sekveneerida 10 000 selgroogse genoomi. Ulatuslikuma eesmärgi on seadnud Hiinas asuv globaalne sekveneerimiskeskus BGI Shenzhen, mille sooviks on sekveneerida nii miljoni inimese, taime, mikroobi kui ka looma genoomi. Põhjused, miks koostus vead esinevad, on mitmesugused. Järjestusetükid on koostu ülesehitamisel kõrvale heidetud (märgistatud kui viga või kordus), tükkide ühinemine on toimunud vales asukohas või tükkide suund on vääralt määratud. Lugemite ühendamisel saadud kontiigid on tihtipeale lühemad, kui nad võiksid olla. Seda põhjustavad koostute jaoks raskemad piirkonnad genoomis: