"segregeeruvate" - 1 õppematerjal

Molekulaarne evolutsioon

mutatsioonikiirus. Teeta väärtust saab hinnata keskmise paaride vahelise erinevuse π abil. See on kõigi võimalike järjestuste paaride summa jagatud paaride arvuga. Eeldusel, et kehtib lõpmatute saitide mudel. 73. Milliseid näitajaid võrdleb Tajima D? Millele viitab positiivne (D > 2), negatiivne (D < -2), nullilähedane Tajima D väärtus? Tajima D võrdleb järjestuste keskmiste paariviisiliste erinevuste arvul (π) ja segregeeruvate saitide arvul (s) põhinevat teeta (Θ) hinnangut. Positiivne Tajima D esineb, kui on palju paariviisilisi erinevusi võrreldes segregeeruvate saitidega – tasakaalustav valik. Negatiivse D korral on vähe paariviisilisi erinevusi ja palju segregeeruvaid saite – positiivne valik ja/või populatsiooni suurenemine. Kui D on nullilähedane, siis paariviisiliste erinevuste ja  segregeeruvate saitide arv on ligikaudselt võrdne – neutraalne evolutsioon. 74