“Valgu biosüntees 2012” loengute põhipunktid
Seinas ei ole laetud AH, hüdrofoobseid AH. Laenguta hüdrofiilsed ühendid, et midagi kinni ei
jäeks. Me ei tea mis konformatsioonis kasvav peptiid tunnelis on, kuid teame, et see on
piisavalt peenike, et enne tunneli lõppu ei saa toimuda migit voltumist (võib ehk olla sunnitud
alpha-heeliksina). Tunnelisse mahub 35-45 AH. Enamus peptiide mahuvad tunnelist läbi, saab
kasutada regulatsioonis (geeniekspressiooni omas nt). Bakterites on valgu ekspordisüsteem.
SecYEG (sekretsioon), SecA (ATPaas, tunneb ära kasvava peptiidi N-terminuses oleva
ekspordisignaalijärjestuse, hakkab kotranslatsiooniliselt valku rakust välja pressima (tõmbab
ribosoomist ka välja, lükkab SecYEG poori)). Ribosoomist väljuvat peptiidi modifitseeritakse
kotranslatsiooniliselt.
A. Nii kui peptiid pistab nina välja, võetakse formüülrühm ära, samuti võetakse Met ära N-
terminuses.
B. Met võidakse ära võtta, aga ei pea. Atsetüülrühma viimine küpse valgu N-terminuses