"rundate" - 1 õppematerjal

Bioinformaatika ülesanded

vastavat programmi (näiteks EMBOSS'i Align EBI kodulehel http://www.ebi.ac.uk/emboss/align/). Varieerida skoorimaatrikseid ja tühikutrahve ning põhjendada erinevusi, võrrelda dot-ploti tulemustega, millise nähtusega on tegemist? Kontrollida punktis 5 tehtud tööd. Vastus: 2. punkti esimese järjestuste paari globaalne joondamine: ######################################## # Program: needle # Rundate: Wed Mar 07 18:02:24 2007 # Align_format: srspair # Report_file: /ebi/extserv/old-work/needle-20070307-18022349260605.output ######################################## #======================================= # # Aligned_sequences: 2 # 1: EMBOSS_001 # 2: EMBOSS_001 # Matrix: EDNAFULL # Gap_penalty: 10.0 # Extend_penalty: 0.5 # # Length: 909 # Identity: 405/909 (44.6%)