Mikroobifusioloogia
sünteesib RNA-d, see subühik vastutab ka DNA-ga ja äsjasünteesitud RNA-ga
mittespetsiifilise seondumise eest. RNAP subühik (rpoB) sisaldab ülejäänud
aktiivtsentrit, mis on RNA sünteesiks vajalik ning osaleb samuti DNA ja RNA-ga
mittespetsiifilises seondumises. RNAP subühik (rpoA) on RNAP kahe koopiana,
N-terminus vastutab RNAP assambleerumise eest ning C-terminus on oluline UP-
elementidega seondumiseks ning regulaatorvalkudega seondumiseks. RNAP
väikseim -subühik (rpoZ) on oluline RNAP assambleerumisel, aitab '-
subühikul seonduda 2 subühikutega ning stabiliseerib RNAP-d. Lisaks
assambleerimisele, osaleb -subühik ppGpp vahendatud transkriptsiooni
regulatsioonis. RNAP, millel puudub -subühik, on ppGpp suhtes tundetud ega
vahenda globaalse alarmooni regulatsiooni. Alarmoon ppGpp seondub ja '
subühiku vahele ning -subühiku N-terminus on vastutav ppGpp regulatsiooni
vahendamise eest. Samas on pakutud, et -subühik ei oma in vivo nii suurt