Genoomika kursuse kordamispunktid vastatud
Minimaalse genoomi mõiste seotud ortoloogsete geenide klastrite mõistega
(COG), sisaldavad ka erinevaid paralooge. Genoomide võrdlemine toob esile 327
universaalset COG-d, defineerides ka organismile vajaliku minimaalse geenide hulga.
Genoomi suurust peegeldab ka genoomi asendatavus (redundancy), mis on võrdne
paraloogia tasemega. Seda omakorda defineeritakse geenide fraktsiooni järgi, millel
on genoomis vähemalt üks paraloog. Paraloogia suhteline tase kahe genoomi vahel
on võrdne RLP12=ruutjuur N1/N2. N1 ja N2 on geenide arv kahes erinevas genoomis.
Paraloogia tase E.coli ja H.influenza jaoks on vastavalt 50% ja 33% ning RLP=1.52,
kui geenide arvu vaheline suhe on 2.5. Mutatsioonimehhanismid, mis otseselt
mõjutavad genoomi suuruse arengut: Kombinatoorne mutatsioonide ja
selektsioonirõhu efekt viib genoomi suuruse kasvule, vähenemisele või stabiilsusele.
25. Prokarüootide genoomide evolutsioon. Prokarüootide genoomid on kompaktsed