Molekulaarbioloogia
probleeme lahendada. Vesiniksidemed katkevad pidevalt oma algDNA-s ja tekivad
edasi liikudes uues. Ühendus liigub nii kaua, kuni tekivad mitmed homoloogilised
piirkonnad. Ühinenud uued dupleksid – lühem ja parem ahel. Pole enam päris
komplementaarsed. Ühelt üksikult mismatchilt liigutakse üle. Mismatche –
mittekomplementaarseid aluspaare tekib mitu. Holliday ühendus jääb pidama. Seal
toimub ahelate lahutamine. Tekib selline ristvorm. Selle juures toimub Holliday
ühenduse lagundamine. Seda saab kahte moodi – kummaltki risti keskelt erinevates
suundades. Lõigatakse üksteisega vastavast kohast ahelad lahti. Ühe lõikamise puhul
tekib rekombinatsioon, teise lõikamise puhul tekib sama, mis oli enne. Kui need, mis
enne kohti ei vahetanud – lõikamata ahelad – tekib rekombinatsioon. Lõikumata ahelat
lõigates tekib rekombinantne molekul. Teistpidi ahelat – juba lõigatud ahelat lõigates.