Imputeerimine
parameetri hinnang? Kuidas mõjutab genotüüp haiguse
esinemissagedust kui a) parameeter on positiivne; b)
parameeter on negatiivne?
20. Konkreetsem ülesanne: Genotüübitunnusele (0, 1 või 2
riskialleeli) vastava parameetri hinnanguks saadakse 0.2 ja
see on statistiliselt oluline. Kui haiguse esinemissagedus
madala geneetilise riskiga indiviididel on 0.1% , hinnake
ligikaudset esinemissagedust 1 ja 2 riskialleeliga
indiviididel.
21. Mis on geneetiline riskiskoor ja kuidas seda praktikas
arvutatakse?
Riskiskoor peegeldab haigestumisriski. Riskiskoori arvutamise mudel
peaks sisaldama haiguse riskifaktoreid (vanus, sugu, perekondlik
eelsoodumus jne) ning olema täpne antud populatsiooni jaoks.
Loendatud riskiskoor = riskialleelSNP1 + riskialleelSNP2 + . . . +
riskialleelSNPn.
Riskiskoor = SNP1 x beta1 + SNP2 x beta2 + . . . + SNPn x betan
Kus beta on SNPide efekti suurus.
22. Kuidas saadakse ROC-kõver ja mida ta iseloomustab?