Genoomi struktuur ja funktsioon
genoomi sisenenud elementideks ja SINEdeks ehk lühikesteks genoomi sisenenud
elementideks. LINEsid umbes 17% ja SINEsid 11%. LINEd kodeerivad ise oma
pöördtranskriptaasi, kuid SINEde transpositsioon sõltub teistest mobiilsetest
elementidest.
•
• Genoomi transposon-elementide kompositsioon inimese genoomi näitel,
rõhuasetusega retrotransposonidel Alu (SINE) ja LINE (L1) elementidel:
päritolu, suurus, struktuur, omadused, jaotuvus genoomis,
retropositsioneerumise mehhanismid, Alu-de roll primaatide evolutsioonis.
• U 45% inimese genoomist on transposoon-elementidega seotud. Suurem osa
neist on mitteLTR retrotransposoonid: LINE1 (L1) ja SINE (Alu). L1 element
koosneb kahest avatud lugemisraamist, mis külgnevad 5’ ja 3’ UTRdega.
5’UTR sisaldab RNA pol II promootorit. Alu element sisaldab kahte
monomeeri, mis on eraldatud A-rikka linkerregiooniga. Üks monomeer RNA
pol III promootorit