Molekulaarbioloogia 2. töö küsimused
Footprintinguga saab määrata ka järjestust, millele uuritav valk
seob.
2) EMSA on kasulik meetod DNAd siduvate valkude kvantitatiivseks analüüsiks. Üldjuhul on DNA
fragmentide elektroforeetiline mobiilsus langenud, kui nad on valguga kompleksis, mis põhjustab
fragmendi geeli asukoha muutust (bänd (värv) jääb maha võrreldes vaba DNAga). Seda analüüsi
saab kasutada tuvastamaks valgulüsaadist regulaatorvalgu olemasolu kasutades tuntud
regulaatorelementi sisaldavat DNA fragmenti, mis on eelnevalt radioaktiivselt märgitud.
Lane 1 is a negative control, and contains only DNA. Lane 2 contains protein as well as a
DNA fragment that, based on its sequence, does not interact. Rida 3 sisaldab valku ja
DNA fragmenti, mis reageerib. Saadud kompleks on suure, raskem ja aeglasem. Muster
real 3 on sellisel juhul kui kogu DNA oleks seotud ja elektroforeesi ajal ei toimunud
üldse kompleksi dissotsieerumist
annaabi.ee 
