Molekulaar- ja rakubioloogia
kasutatavate lahuste kogused ning tsentrifuugimise ja inkubeerimise ajad
olema optimaalsed, igasugune kõrvalekalle vähendab saagist või eraldatud
DNA puhtusastet. Saagise kogust mõjutavad tegurid:
i. rakkude vedelsöötmes kasvatamise aeg (optimaalne on 16h, kui
kasvatada liiga vähe, ei jõua rakud paljuneda, kui liiga kaua, võib
tekkida saaste või võivad rakud DNA rakkudest väljutada)
ii. rakusademe E1 lahuses suspendeerimise hoolikus (kui sade pole
täielikult lahustunud, ei lüüsu segu täielikult
iii. E2 lahusega inkubeerimise aeg (kui inkubeerida liiga vähe, ei jõua
rakud lüüsuda ning saagis jääb väike, kui aga liiga kaua, siis lisandub
saagisele bakteri genoomseid järjestusi ning väheneb renatureeruva
plasmiidse DNA kogus
iv
annaabi.ee 
