Molekulaardiagnostika
oligonukleotiid. Oligokiibid:
Uuritakse absoluutset geeniekspressiooni taset
kui palju saab sekveneerida (?)
SNPde genotüpiseerimine
Spotitud cDNA mikrokiibid: DNA kloonid klaasile, kuhu hübridiseeritakse RNA, millest
tehtud cDNA, mis värvitakse ja hübridiseeritakse microarrayga. Kahe laseriga (punane,
roheline) mõõdetakse tulemit. Arvuti arvutab välja ekspressioonitasemete pildi: midagi on
tõusnud, midagi langenud, midagi samaks jäänud. Näiteks anname rakukle kuumasoki ja siis
analüüsime 2000 geeni reaktsiooni.
plussid:
odavamad,
paidlikumad,
võrreldakse paralleelseid proove;
miinused:
vaja olla 100% kindel, mida kiibile paned,
mõõdetakse suhtelist ekspressioonitaset (ekspressioonitasemete vahe).
Spotterid e tilgutusnõelad -> tilk klaasile, kus igas augus on järjestus.
Kasutamine:
SNPd
mutatsioonid
ekspressioonianalüüs
interaktsioon
Põhiplatvormid:
cDNA kiibid