"puutaoline" - 1 õppematerjal

Genoomika kursuse kordamispunktid vastatud

Genoomide suurus korreleerub geenide arvuga. Esineb võime integreerida geneetilist materjali väljastpoolt ning seda ka kiirelt kaotada. Genoom sõltub otseselt bakteri ökoloogilisest nisist. Selle tõttu on genoom väga dünaamiline ning jaotub põhiliseks, universaalseks endogenoomiks ja integreeruvaks eksogenoomiks. Sage on lateraalne ehk horisontaalne geneetiline ülekanne ehk geenide import. Muudab evolutsioonitempot. Selle tõttu bakterite fülogenees ei ole puutaoline ning seda ei saa esitada monofüleetiliste taksonite järgi. Metagenoomid: Evolutsioonilisest lähtepunktist ei saa vaadelda vaid ühe liigi DNA-d vaid terve bakterikoosluse genoome teatavas nisis. Seda lähenemist iseloomustab mõiste metagenoom, Kuna enamikke mikroorganisme laboris kasvatada ei saa, puudub informatsioon valdava osa mikroobide kohta. Sellest ka vajadus massiliseks sekveneerimiseks, Võimalik rekonstrueerida erinevate organismide täielike genoome, Lähtub pigem mitte