Molekulaarne evolutsioon
Mudelipõhisteks meetoditeks on suurima tõepära meetod ja Bayesi
meetod. Mudelid on vajalikud, et kompenseerida mutatsioonilist
küllastumist, et kaasata eelteadmisi evolutsiooni/puu kohta.
mudelisse saab kaasata peale kitsalt evolutsioonipuu omade ka teisi
parameetreid.
64. Kas Bayesi meetod annab parameetritele
punkthinnangud? Kommenteeri vastust.
Ei. Bayesi meetodi puhul pole parameetritel punkthinnanguid, vaid
jaotused.
65. Mis on “mägironimise” algoritmi eesmärk?
Optimaalse puu otsimisel võib võimalikke puid vaadelda maastikuna,
kus parimad puud paiknevad küngaste tippudes ja kehvemad orus,
ümberkorraldusi tehes liigub parema puu suunas. Algsel puul
hakatakse oksi ümber paigutama, et leida parim puu. Võib harusid
ümber paigutada, vahetada, puu katkestada ja taasühendada jne, et
leida paim puu.
66
annaabi.ee 
