Molekulaarne evolutsioon
evolutsiooni mudelid, mis diferentseerivad asenduste kiirusi
ja järjestuste aluspaarilist koostist, töötaksid korrektselt?
Milliseid kõrvalekaldeid eeldustest võib esineda? Tooge
näiteid mudelitest, mis neid kõrvalekaldeid arvesse püüavad
võtta!
Eeldused:
1. Mudelist tulenevad asenduse kiirused kehtivad kõigile
nukleotiidipositsioonidele. Kõrvalekalded: keskmised asenduse
kiirused imetajate geenides ja pseudogeenides on erinevad.
Asenduse kiiruse varieerumist nukleotiidipositsiooniti võtavad
arvesse GTR + I, GTR + Γ, GTR + I + Γ.
2. Nukleotiidi asendus ühes nukleotiidipositsioonis ei mõjuta
nukleotiidi asendust teistes nukleotiidipositsioonides.
Kõrvalekalded: kompensatoorsed asendused rRNA geenides (C
G asendus).
3. Asenduse kiirus on konstantne ajas ja liinides. Kõrvalekalded:
annaabi.ee 
